La Loge La Tolérance est rattachée à la Grande Loge Suisse Alpina (GLSA), obédience officielle suisse, reconnue par la Grande Loge d'Angleterre. Cette obédience est dite régulière.
La Franc-Maçonnerie ne présente pas un aspect unitaire; elle se compose au contraire d'un nombre étendu de systèmes ou de rites, apparus à une période et dans un contexte géographique, voire social particulier. La Grande Loge Suisse Alpina est née de l'union de Loges ayant appartenu à ou se réclamant de plusieurs Grandes Loges ou Grands Orients étrangers. Elle présente dès lors dans ses systèmes et rites une variété que l'on ne retrouve guère dans une autre obédience.
Ce développement est encore favorisé par le fait que ce sont les Loges elles-mêmes qui demeurent souveraines en matière de rituels. En effet, il y a découplage entre les autorités des rites administrant les degrés dits "ajoutés" (ou Hauts Grades) et celles de la Grande Loge Suisse Alpina, fédération d'Ateliers pratiquant les degrés d'Apprenti, Compagnon et Maître. Chaque Loge a donc en principe le droit de mettre en place ses propres cérémonies (ou de les modifier), sous réserve de l'approbation de la GLSA, pour autant que celles-ci soient compatibles.
